细菌性肺炎占成人各类病原体肺炎的80%，进入抗生素时代以来，细菌性肺炎的预后一度显著改善，但自60年代以后病死率居高不降，目前细菌性肺 炎出现一些新特点，包括病原谱变迁，特别是医院内肺炎G-杆菌比率显著上升，肺炎链球菌虽然在社区获得性肺炎病原体中仍占主导地位，但临床表现多趋于不典型。
细菌性肺炎大多由肺部感染都是通过微量吸入(micro-aspiration)或吸入病原菌所引起。仅有很少数的肺部细菌感染是来源于 血行传播的结果(如脓毒栓子)。很多人的鼻孔有潜在的呼吸道病原体定植;肺炎链球菌及金黄色葡萄球菌是常见的定植菌。那些曾在医疗机构停留过一段时间的患 者(有时是执业护理者)可能有多重抗生素耐药的细菌和与普通人群不同种类的细菌定植。抗生素治疗的推荐，即便在有了明确的微生物鉴定结果时，也应按照抗生 素的药敏试验及当地易感菌群和耐药菌谱的情况来定。
按解剖学分类，肺炎可分为大叶性、小叶性和间质性。为便于治疗，现多按病因分类，主要有感染性、理化性(如放射线、毒气、药物)以及变态反应性(如过敏性肺炎等)，临床所见绝大多数为细菌、病毒、衣原体、支原体、立克次体、真菌和寄生虫等引起的感染性肺炎，其中以细菌最为常见。
肺炎的病原体因宿主年龄、伴随疾病与免疫功能状态、获得方式(社区获得性肺炎或医院内肺炎)而有较大差异。社区获得性肺炎的常见病原体为肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、金黄色葡萄球菌、化脓性链球菌、军团菌、厌氧菌以及病毒、支原体和衣原体等，而医院内肺炎中则以绿脓杆菌与其他假单胞菌、肺炎杆菌、大肠杆菌、阴沟与产生肠杆菌、变形杆菌、耐甲氧西林金葡菌(MRSA)和真菌等常见。吸入性肺炎大多数为厌氧菌感染。
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