典型的阴茎癌患者，通过临床查体，诊断并不困难。确诊该病需要取病变处组织做病理学检查。显微镜下最常见的是角化型和中分化鳞状细胞癌。阴茎鳞状细胞癌中还有基底样癌、湿疣状癌、乳头状癌、肉瘤样癌、混合性癌和腺鳞癌7种亚型。其他类型阴茎癌较罕见。
1、影像学检查
(1)淋巴造影：对诊断转移有一定帮助，一般不作为常规检查，选择经足背部，阴茎，精索淋巴管注射造影法，若有转移可显示淋巴结不规则，充盈缺损，淋巴管变形，受压阻塞等征象。
(2)B超：可确定肝脏，腹腔有无转移灶。
(3)CT、MRI检查：检查腹膜后及脏器有无转移。
2、其他检查
当病变仅有硬结尚未破溃，如有包皮覆盖，则应行包皮环切将病变部位暴露。局部活组织病理检查，可明确诊断。活组织检查为最重要的组织学诊断依据，原发癌肿进行活组织检查可明确癌肿的组织学类型及病理分级;腹股沟淋巴结活检可明确有无癌转移，有助于临床分期和治疗方案的制定。
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