对焦虑的起因，不同学派的研究者有不同的意见。这些意见并不一定是相互冲突的，而是互补的。如在清华大学出版社的著作《心灵杀毒2.0——弗洛伊德的拼图》中也进一步指出强迫焦虑是心灵呼吸的哮喘症，发明了以此原理开发的缓解焦虑、解除痛苦的有效心理自助方法，以上说明神经回路信息传导不畅与焦虑症相关。以下是引起焦虑的病因分析。
1、躯体疾病或者生物功能障碍虽然不会是引起焦虑症的单独原因，但是，在某些罕见的情况下，病人的焦虑症状可以由躯体因素而引发，比如，甲状腺亢进、肾上腺肿瘤。许多研究者试图发现，是不是焦虑症患者的中枢神经系统，特别是某些神经递质，是引发焦虑症的罪魁祸首。很多研究集中在两个神经递质上：去甲肾上腺素和血清素。很多研究发现病人处于焦虑状态时，他们大脑内的去甲肾上腺素和血清素的水平急剧变化，但是未确定这些变化是焦虑症状的原因还是结果。
2、认知过程，或者是思维，在焦虑症状的形成中起着极其重要的作用。研究发现，抑郁症病人比一般人更倾向于把模棱两可的、甚至是良性的事件解释成危机的先兆，更倾向于认为坏事情会落到他们头上，更倾向于认为失败在等待着他们，更倾向于低估自己对消极事件的控制能力。
3、在有应激事件发生的情况下，更有可能出现焦虑症。而甲状腺素、去甲肾上腺素这些和紧张情绪有关的激素的分泌紊乱(过量)则对以上过程有放大作用。
4、神经回路假设，2007年，国际优秀科学杂志《自然》发表了中科院上海生科院神经科学研究所客座研究员、美国杜克大学教授冯国平的研究成果，首度揭示了强迫、焦虑和压抑的生理机制，指出“皮质-纹状体-丘脑-皮质回路”出现信息传导不畅是产生焦虑、压抑、强迫的病理原因。
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