小二幽门螺杆菌感染临床常为慢性胃炎和溃疡的表现，无特征性，主要依靠实验室检查诊断，1999年7月在昆明召开第二届小儿消化内镜及消化系统疾病学术会议上，讨论通过了Hp感染的诊断及治疗标准如下：
Hp感染的诊断标准：
1、培养阳性。
2、切片染色见到大量典型细菌者。
3、切片见到少量细菌，尿素酶试验，13C-尿素呼气试验，血清学Hp-IgG，Hp核酸任意2项阳性。
4、内服用抗生素者，上述检查可呈假阴性。
Hp治疗标准：停药1个月以上进行复查，上述检查转为阴性者为治疗。
鉴别诊断：
与其他原因所至慢性胃、十二指肠炎症和溃疡相鉴别，主要依靠实验室检查结果鉴别。Hp具高度尿素酶活性，能分解尿素产生NH+4，通过测NH+4存在与否，间接判断有否Hp感染。给患者口服14C尿素，如有Hp感染，20min后患者呼出的气体中有14CO2，无Hp感染则无14CO2呼出。应用ELISA方法检测血清或唾液中的抗Hp IgG或抗Hp IgA，为特异性和敏感性指标。
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