西医认为阴道的环境经常受到宿主的代谢产物、细菌本身的产物及外源性因素(性交、冲洗及其他干扰)而不稳定。阴道菌群非常复杂，除原虫、真菌外，尚包括很多需氧菌及厌氧菌，这些微生物可分为共栖的及病理性的，都生长在一个共同的环境内，各微生物之间可能有桔抗作用。另一个影响其生长的是氢离子浓度，在pH3.8～4.2时，有利于共栖菌的繁殖，尤其是乳酸杆菌，这是健康阴道中的主要菌种，阴道液中的密度可达105～108ml，当阴道被微生物感染后，假使乳酸杆菌占优势，仍能维持pH3.8～4.2，则不会致病，而且乳酸杆菌还能产生H202，对其他微生物有毒性作用而遏制其繁殖。其他如乳链球菌、肠杆菌、变形杆菌、加夫基球菌、韦永球菌等在阴道下端常见，平时不产生症状。阴道菌群之间彼此制约，使病理细菌不能有所作用，假使这种平衡被破坏，互相制约作用消失，所以氢离子浓度下降，乳酸杆菌失去优势，病理菌得以繁殖，就产生症状。
细菌性阴道病是由于阴道内乳酸杆菌减少而其他细菌大量繁殖，主要有加特纳氏菌、各种厌氧菌及支原体引起的混合感染。滴虫性阴道炎由阴道毛滴虫引起，属性传播性传染病，传染途径通过直接传染(通过性交传播，患滴虫性阴道炎的配偶，其精液中75%可找到滴虫)和间接传染(通过各种浴具、游泳池、公共厕所或污染的衣服、器械)，在普查中，滴虫的检出率为 3.56%，其中有部分妇女无炎症表现称之为带菌者。念珠菌性阴道炎主要由白色念珠菌引起，正常健康阴道内，亦常可少量寄生此菌，但一般不发病，当机体免疫功能低下或发生菌群失调时即繁殖面致病，故多见于妊娠、糖尿病、应用免疫遏制剂、长期抗生素应用者，另外在潮湿湿热的环境中，也易感染。据统计，非孕妇女中约10%及孕妇中三分之一感染本病，但因症状明显而就诊者少。至于非白色念珠菌(如光滑球拟酵母菌等)引起的阴道炎的发病率由1988年的9.9%上升到1995年的17.2%，已感染HIV的妇女受非白色念珠菌感染者比来感染者多两倍;患复发性念珠菌性阴道炎的妇女感染非白色念珠苗比感染白色念珠菌多2.47倍。
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