对于垂体功能低下的预防，主要体现在如何在治疗后防止出现垂体功能低下的情况，很多治疗方式都会对垂体功能进行破坏，因此做好垂体功能低下症的预防是十分有必要的。
由于垂体功能低下症的预防非常重要，因此垂体瘤患者在治疗当中要极为注意：
首先，立体定向放射外科技术尤其是伽玛刀能有效地破坏病灶，尤其对颅内多发的生殖细胞瘤，以分次治疗及剂量分割代替单次大剂量照射即可使病灶内的放射剂量分布更加均匀，又保护了病灶周边正常颅内重要结构，提高患者中枢神经系统辐射耐受性，从技术手段上来讲减少了单次大剂量照射带来的副反应。
其次，从照射剂量及照射范围选择来讲，目前(2010年)发现对于恶性程度相对较低的生殖细胞瘤，肿瘤部位与脑脊髓轴分别应用较小剂量的照射也能取得满意疗效，发生原位复发及种植播散的可能性都较小。而全脊髓照射的选择也在多项研究中证实对于疾病的完全缓解并没有增强作用，反而带来一些副反应。
最后，放疗联合化疗是有效避免放疗后遗症的重要方向。单独应用化疗治疗颅内生殖细胞瘤的研究也有不少，但复发率高且有一定副反应。2种方法的联合应用取长补短，在治疗儿童肿瘤患者，减少中枢神经系统损伤中可加以选择。
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