鉴别诊断：
1.其他脑寄生虫病
如脑棘球蚴病，脑猪囊尾蚴病，脑阿米巴病，脑弓形虫病等，主要依赖于流行病学特征，特异性免疫诊断及典型影像学检查加以区别。
2.脑部非寄生虫感染性疾病
如脑炎，脑脓肿，脑结核等。
3.脑部非感染性疾病
如脑梗死，脑血管畸形，结节性硬化及多发性硬化等。
4.脑瘤和脑转移瘤。
脑型肺吸虫病检查项目:
白细胞及嗜酸性粒细胞常增加，在急性期白细胞可达40×109/L(4万/mm3)，嗜酸性粒细胞可高达80%，痰，粪以及任何体液和组织活检标本中发现肺吸虫的成虫，童虫或虫卵均是诊断的有力证据，脑脊液中可发现嗜酸性粒细胞增多，蛋白含量增高，偶可检出虫卵，在组织破坏期尚可出现血性脑脊液，在囊肿形成期脑脊液压力升高，蛋白增多，而其他可正常，这种脑脊液的多变性是本病的特点之一。
免疫学检查目前常用的有皮内试验，酶联免疫吸附试验(ELISA)，斑点法酶联免疫吸附试验，补体结合试验等，其阳性率均可达98%左右，亦有相当的特异性，对血吸虫病，华支睾吸虫病，姜片虫等其他寄生虫病有不同程度的交叉反应，脑脊液的补体结合试验对本病有较特异的诊断价值。
头颅摄片，CT，脑血管及脊髓造影可发现病变和阻塞部位，CT平扫图像在急性期表现为脑水肿，脑实质可见大小不一，程度不等的低密度水肿区，脑室狭小，造影后不增强;在囊肿期则出现高密度的占位病变表现，但边界不清，增强扫描病灶有强化;纤维瘢痕期则表现为钙化灶，在MRI影像中T1加权表现为中央高信号或等信号，外周低信号的病灶，T2加权则表现为中央高信号周边低信号的病灶，国外有人报道MRI较CT更易发现大脑半球沟回处的病灶。
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