男性不育体检主要从以下六大方面着手：
一、精液常规检查
这是测定男性生育力的最基本、最重要的临床指标，有关精液的参数是医师最先需要了解的，患者要注意的是：3—5天不同房去检查;较好用手淫方法取标本;要能保证获得全部精液;2周内复查1—2次。
二、精浆生化检查
对精浆的化学成分分析有助于对附睾、前列腺、精囊腺功能的了解。患者有精液量少、无精症、少精症、不明原因的精子活动力下降、附属性腺先天缺陷及附属性腺疾病等情况时，可作精浆生化检查，常见有果糖、肉毒碱、酸性磷酸酶等。
三、与男性不育有关的微生物检查
男性泌尿、生殖系统感染常常导致男性不育，与男性泌尿、生殖系统感染有关的病原微生物有细菌、病毒、螺旋体、支原体、衣原体等，常见有淋球菌、乳头状瘤病毒、腺原体、沙眼衣原体等。
四、与男性有关的内分泌检查
生殖内分泌功能障碍影响男性的性功能和生殖功能，是男性不育症的一个重要原因，内分泌检查主要是有关性激素T、FSH、LH、PRL、E2的测定和各种激发试验，如HCG刺激试验等。
五、与男性不育有关的遗传学检查
男性相关染色体及基因的正常是维持正常生殖功能的基础，染色体及基因的异常对导致性分化异常和(或)精子生成障碍，从而严重影响生殖功能。因此，对现有性别分化异常或身体有其他遗传缺陷、无精症和严重少精症、有遗传病家族史、习惯性流产夫妇做染色体及基因检查，有着十分重要意义。
六、前列腺液检查
前列腺炎可导致男性不育症。前列腺液检查可为前列腺炎的诊断提供依据。
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