慢性萎缩性胃炎的主要病变为胃固有腺(在胃窦部为幽门腺、胃底部为胃底腺、在贲门为贲门腺)的萎缩，肠上皮化生及炎性反应。
慢性萎缩性胃炎的炎性反应与浅表性胃炎相似，但较其为重，固有腺中有大量淋巴细胞和浆细胞浸润。浸润深度常达粘膜肌层，形成淋巴集结和淋巴滤泡等也较多。炎症细胞亦可浸润腺体，破坏腺体结构，使腺腔内充满炎症细胞。
慢性萎缩性胃炎的病理介绍
腺体萎缩发生于腺颈部以下的固有腺体，主要表现为腺体缩小，数目减少;萎缩重者，大部分腺体丧失，粘膜变薄。萎缩区常被浸润的炎症细胞、增生或化生的腺体所占据。其中可见不规则分布的残留腺体，有时呈现囊状扩张。胃体部腺体萎缩，主要是壁细胞和主细胞萎缩消失，严重者两种细胞完全消失，因此胃酸和胃蛋白酶的分泌也随之消失;胃窦的萎缩使胃窦粘液腺丧失，中性粘液的分泌减少。
萎缩较重部位，表面上皮及小凹上皮亦发生萎缩，小凹变浅甚至变平。根据固有腺受影响的情况可将慢性萎缩性胃炎分为轻度、中度和重度三级，即胃的固有腺体较正常量减少1/3以内者为轻度，减少1/3～2/3者为中度，减少2 /3以上者为重度。慢性萎缩性胃炎随病情发展可形成全胃萎缩，其时整个胃体粘膜萎缩变薄，所有腺体完全消失或代之以肠化生腺体。
肠上皮化生在萎缩性胃炎时很常见，它是萎缩性胃炎的比较突出的病变。其常发生于幽门窦，继而向小弯、大弯、胃体部扩展。肠上皮化生轻者只是少量的杯状细胞，重者可见大量的肠绒毛上皮。此外尚可见潘氏细胞及嗜银细胞，腺窝增生屈曲延长，粘膜肌正常或增高，粘膜全层变薄。
此外，胃萎缩病变中亦可见腺体不典型增生，这是一种癌前病变状态，如不及时治疗，就可能发展成胃癌。
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