生殖器疱疹的主要病原体，存在于皮肤和粘膜损害的渗出液、精液、前列腺分泌液、宫颈、阴道分泌液中。生殖器疱产生的病因，主要通过性交传染。当机体抵抗力降低或某些激发因素如发热、感染、月经、受凉、胃肠功能紊乱、创伤等作用下，都是导致生殖器疱疹产生的病因。生殖器疱疹多由单纯疱疹病毒(HSV-2)感染所致，该病毒广泛地存在于精液、前列腺液、皮肤渗液及女性的阴道分泌物中，主要通过性交传染。初次感染疱疹病毒，即可被称为原发性生殖器疱疹。 原发性疱疹潜伏期为2-10日，平均为6日，发病后如果未能治疗彻底，残存于体内的病毒一段时间后又会发作，引发二度疱疹，也就是所谓的复发性生殖器疱疹。
生殖器疱疹是主要由单纯疱疹病毒II引起的性传播病。在西方国家其发病率仅次于淋病和非淋菌性尿道炎。本病发病率高，可通过胎盘及产道感染新生儿，导致流产及新生儿死亡，与宫颈癌的发生也有关，危害较大。生殖器疱疹好发于龟头、冠状沟、阴茎或尿道口，随着病情的发展，患处会形成脓疱、糜烂或溃疡，且有灼痛。其中约90%的患者，其疱疹病毒可累及直肠，造成直肠肛门痛。另一方面，如果不能及 时控制住病情，疱疹病毒便会循尿路上行，并发尿道炎、膀胱炎或前列腺炎，从而形成交叉感染，严重威胁整个生殖系统的健康。拖延到后期，更有致癌的可能。为避免这一系列危害，单独的办法就是及时进行治疗。
此外，肉体的痛苦加上精神的负担，往往使患者自尊心受挫，使之不愿与异性交往，从而导致性功能障碍，影响夫妻感情及家庭的和睦，久而久之甚至发生抑郁症。
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