引起小儿腹泻病的病因分为：(1)感染性：如病毒、细菌、真菌和寄生虫等感染;(2)非感染性：包括饮食性、过敏性、先天酶缺陷及气候等因素引起的腹泻。
1.感染因素
肠道内感染：可由病毒、细菌、真菌、寄生虫引起，以前两者多见，尤其是病毒。
(1)病毒感染：寒冷季节的婴幼儿腹泻80%由病毒感染引起，以轮状病毒最常见，其次有星状和杯状病毒、肠道病毒，包括柯萨奇病毒、埃可病毒和肠道腺病毒等。
(2)细菌感染：大肠杆菌、空肠弯曲菌、耶尔森菌、沙门菌等。
(3)真菌：致腹泻的真菌有念珠菌、曲菌、毛霉菌，小儿以白色念珠菌多见。
(4)寄生虫：常见为蓝氏贾第鞭毛虫、阿米巴原虫和隐孢子虫等。
肠道外感染：如患中耳炎、上呼吸道感染、肺炎、泌尿系感染、皮肤感染或急性传染病时，可由于发热、感染原释放的毒素、抗生素治疗、直肠局部激惹作用而并发腹泻。
(5)滥用抗生素引起的腹泻：长期、大量地使用广谱抗生素可引起肠道菌群紊乱，肠道正常菌群减少，耐药性金黄色葡萄球菌、变形杆菌、绿脓杆菌或白色念珠菌等大量繁殖，引起药物较难控制的肠炎，有学者称之为抗生素相关性腹泻。
2.非感染因素
(1)饮食因素：喂养不当;过敏性腹泻，如对牛奶或豆浆等过敏而引起;原发性或继发性双糖酶(主要为乳糖酶)缺乏或活性降低，肠道对糖的消化吸收不良而引起腹泻。
(2)气候因素：气候突然变化、腹部受凉，或天气过热消化液分泌减少等诱发消化功能紊乱致腹泻。
冬季天气寒冷，家长要注意宝宝腹部保暖，注意饮食，避免引起宝宝腹泻。
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