早期的心内膜心肌活检组织形态学研究中由于诊断标准不一致，病毒性心肌炎在心肌活检中的检出率存在着较大的差异，约为0%-62%。专家制定了诊断心肌炎的Dallas标准，首次将心肌炎按心内膜心肌活检的组织形态学诊断分为三种类型。
有明显的心肌细胞坏死及(或)变性，间质炎细胞浸润减少，伴或不伴间质纤维化，此改变为明确的心肌炎。
光镜下未发现明确的心肌损伤征象，炎症细胞浸润较少，此改变为临界性心肌炎，需要重复进行心内膜心肌活检。
光镜下心肌组织形态学正常，证明无心肌炎。
随访的心内膜心肌活检组织形态学诊断分为三级：
与前次心内膜心肌活检比较，炎细胞浸润及心肌细胞变性与坏死无缓解或加重，伴或不伴间质纤维化，为持续进展性心肌炎。
与前次心内膜心肌活检比较，炎细胞浸润明显减轻，可见心肌组织修复痕迹，伴或不伴间质纤维化，为恢复期心肌炎。
与前次心内膜心肌活检比较，炎细胞浸润消失，病灶修复，可见明显灶性或融合性或弥漫性间质纤维，为已愈合心肌炎。
出现急性临床症状时进行心内膜心肌活检尤为重要，宜在急性病毒感染之后6周内进行心内膜心肌活检，由于本病的病理特点，多部位取材尤为重要。
通过心肌活检组织形态学定量与半定量分析可以判定心肌炎的炎症恢复阶段及病变程度等，对正确判定预后以及指导临床治疗等起重要的作用。
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