诊断
流行季节有腹痛，腹泻及脓血样便者即应考虑菌痢的可能，急性期病人多有发热，且多出现于消化道症状之前，慢性期病人的过去发作史甚为重要，大便涂片镜检和细菌培养有助于诊断的确立，乙状结肠镜检查及X线钡剂检查，对鉴别慢性菌痢和其他肠道疾患有一定价值，在菌痢流行季节，凡突然发热，惊厥而无其他症 状的患儿，必须考虑到中毒型菌痢的可能，应迟早用肛试取标本或以盐水灌肠取材作涂片镜检和细菌培养。
鉴别诊断
(一)阿米巴痢疾：起病一般缓慢，少有毒血症症状，里急后重感较轻，大便次数亦较少，腹痛多在右侧，典型者粪便呈果酱样，有腐臭，镜检仅见少许白细胞，红细胞凝集成团，常有夏科-雷登氏结晶体，可找到阿米巴滋养体，乙状结肠镜检查，见粘膜大多正常，有散在溃疡，本病易并发肝脓肿。
(二)流行性乙型脑炎：本病表现和流行季节与菌痢(重型或中毒型)相似，后者发病更急，进展迅猛，且易并发休克，可以温盐水灌肠并做镜检及细菌培养，此外，本病尚应与沙门氏菌感染，副溶血弧菌食物中毒，大肠杆菌腹泻，空肠弯曲菌肠炎，病毒性肠炎等相鉴别，慢性菌痢应与慢性血吸虫病，直肠癌，非特异性溃疡性结肠炎等鉴别。
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九个月以前传染了细菌性痢疾一直没救治好可能会是病人所传染的病菌对所动用的药物具备抗药性所致使，可以去医院做血常规和便常规以及肠镜的仔细检查对病情实施明确，然后通过做细菌培育和药敏实验来决定敏感的抗生素...
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