非淋病性尿道炎不是由淋病双球菌引起的尿道炎。多见的病原体为衣原体和支原体，其他还有阴道滴虫、疱疹病毒、包皮杆菌、白色念珠菌均可为病原。总之，概括地说，把一切不是由淋病双球菌所引起的特异性尿道炎统称为非淋病性尿道炎()。
一、病因病原体：下面主要描述衣原体和支原体。
衣原体：是一种原核微生物，呈球形，在细胞内生长繁殖，并被细胞浆包围形成内涵物，但与病毒不同，它有DNA和RNA，直径为0.1~0.3微米，无运动能力。介于立克次体和病毒之间。大量研究目前已证明砂眼衣原体可引起男性尿道炎--非淋病性尿道炎，占尿道炎的30~50%。还可引起子宫结膜炎，新生儿结膜炎、新生儿肺炎等。
支原体：直径0.1~0.3微米，它没有坚硬的细胞膜，只有三层环状带，因而没有固定的形态，可随环境而变化，在液体中有的呈环形或球形。已知支原体59种中有10种在人体中发现，从中有人型支原体、肺型支原体及尿素支原体三种被认为可以致病。10%非淋病性尿道炎是由尿素支原体引起。
感染途径：非淋病性尿道炎，男性通过性交约使30~70%的女性被感染衣原体，女性患衣原体性子宫颈炎经性交传染给男性。泌尿生殖系统或邻近脏器炎症的蔓延引起的尿道炎，如细菌性尿道炎、细菌性前列腺炎以及外伤、化学刺激等引起的尿道炎症与性行为感染的非淋病性尿道炎有所区别。
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