多数急性或慢性腹泻患者只需根据病史，体征及必要的实验室检查，如粪便常规及培养等即可明确诊断，当一般常规检查后仍不能作出诊断时，应考虑作进一步检查，但由于可供检查的项目甚多，故必须结合每例患者腹泻的特点而作出选择，例如，当判断患者腹泻系小肠疾病所致的可能性大时，应选择对小肠疾病诊断有帮助的检查;如考虑腹泻是大肠疾病所致，则应选择对大肠疾病诊断有帮助的检查。
一、慢性腹泻的实验检查
1、粪便检查：出血、脓细胞、原虫、虫卵、脂肪滴等。
2、血液检查：血红蛋白、白细胞及其分类等都有助于慢性腹泻的诊断。
3、小肠吸收功能测定：显示肠道吸收不良。
4、X线及内窥镜检出病变位置、运动功能状态、胆石等。
5、B超显像
6、小肠黏膜活组织检查。
7、血浆激素和介质测定：对分泌性腹泻的诊断具有重要意义。
8、内镜检查：结肠镜检查和活检可以发现结肠肿瘤、炎症性肠病、放射性肠炎、缺血性肠炎和肠道特异性炎症等。
最简单而有意义的检查是反复多次查大便常规，根据大便镜检白细胞的有无及多少，可初步区分感染性腹泻或非感染性腹泻。其次是病原学检查，各种细菌培养、查阿米巴原虫及病毒等，有些项目需要有一定条件，但如获阳性结果，有确诊意义，并可指导治疗。此外，尚可进行下列检查：
(1)肛门指诊：简单易行，直肠癌大部分在直肠，均可通过肛门指诊触及，故对于诊断直肠癌极有意义。
(2)乙状结肠镜检查：简单易行，检查1次只需5分钟，痛苦小，可直接看到肠粘膜病变，并可在检查过程中取肠粘膜活检及作肠拭子细菌培养，阳性率高，故对于鉴别诊断意义大。
(3)纤维肠镜检查：可以从肛门看到回盲部，视野清晰，检查全面、直接，可以发现比较轻微、范围小的病变，可摄片、拍电影录像，是最有意义的鉴别诊断方法，值得推荐。目前纤维肠镜在全国范围内比较普及。部分患者在检查过程中感到腹痛明显，偶有诱发冠心病者或导致肠穿孔，但只要术者细致，是可以避免的。
(4)钡灌肠：部分患者，肠道狭窄或痉挛，肠腔不易通过，需要进行钡灌肠。可观察全结肠病变，且钡灌肠更为安全，痛苦小，可弥补纤维肠镜之不足。
二、慢性腹泻的诊断依据
慢性腹泻的诊断主要依靠病史、体征、直肠指检、粪便检查，如有困难，再进一步作乙状结肠镜、X线检查，仍不能解决时，再考虑作纤维结肠镜或小肠镜检查，必要时作各种功能试验，如小肠吸收功能试验(葡萄糖耐糖试验、右旋木糖实验、放射性核素标记维生素B12实验)和胰腺功能实验。
温馨提示：直肠指检对直肠的病变，如直肠癌，溃疡性直肠炎，直肠息肉等病变的诊断极有价值，对大便伴有黏液，脓血者，直肠指检应列为首选的常规检查。
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