肝血管瘤和肝癌的诊断是这样，当CT片子上的阴影小于4公分时，往往会影响到诊断的正确性，而且越小就越困难，因此，无论是CT、核磁，还是超声医生，当他们出具检查报告时，都说是肝血管瘤可能性大，没有说一定是肝血管瘤，让继续观察，都留有一定的余地，不说绝了，以免被动，这就影响了一些患者的及时治疗。
鉴别诊断主要考虑：
1. 右膈下脓肿：膈下脓肿常有先驱病变，如胃、十二指肠溃疡穿孔后弥漫性或局限性腹膜炎史，或阑尾炎急性穿孔及上腹部手术后感染等，主要表现为胸痛和深呼吸时疼痛加重。B型超声检查可明确诊断。
2. 原发性肝癌：巨块型肝癌中心区液化坏死、继发感染，易与孤立性肝脓肿混淆，但肝癌患者病史、体征与肝脓肿不同，再结合甲胎蛋白(AFP)检测和B超或CT检查，一般能够鉴别。
3. 肝囊肿合并感染：肝包虫病和先天性肝囊肿合并感染时，其临床表现与肝脓肿相似，只有详细询问病史和检查才能加以鉴别。
4. 胆囊炎、胆石症：常有反复发作病史，全身反应较轻，可有上腹部绞痛且放射至右背或肩胛部，胆囊区压痛明显;X线检查膈肌不升高，运动正常，B型超声检查无液性暗区。
5. 右下肺炎：有时也可与肝脓肿混淆，但详细询问病史、仔细查体及行胸部X线检查有助于鉴别诊断。
从医学上来说，肝脏主要是供应能量的脏器，如果不能满足患者的能量消耗，肝脏必需快速新生肝细胞来补充必需要的数量。肝纤维化越重，炎症破坏越猛，新生的肝细胞越多越幼稚，这些幼稚的新生肝细胞就会产生AFP。肝癌细胞是最最幼稚的原始肝细胞，产生的AFP会比其他肝病多许多，但小肝癌的AFP水平也可以不很高;重度活动性肝硬化的AFP也可以高到1000以上，单独一次AFP检查不容易确定是不是肝癌。
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