一、药物治疗
皮肤念珠菌病的治疗 可选用外用药物进行治疗，如特比萘芬、克霉唑、萘替芬、布替萘芬、制霉菌、咪康唑、酮康唑等霜剂和软膏制剂。也可口服酮康唑、两性霉素B。
口咽、外生殖器念珠菌病 病情较轻这可局部应用制霉菌素、氟脲嘧啶软膏，也可口服克霉唑、酮康唑、氟康唑、伏立康唑片、两性霉素B。制霉菌素悬液与克霉唑锭剂(clotrimazole troches)对治疗口腔鹅口疮的疗效相等，但后者的耐受性较好。对AIDS患者，制霉菌素悬液应用于口咽或食管念珠菌病的疗效，不如克霉唑锭剂或其他口服咪唑类药物。而氟康唑(片剂或悬液)和伊曲康唑(口服环糊精溶液剂)，则疗效比酮康唑更好。念珠菌阴道炎患者还可以应用咪康唑(1200mg)、克霉唑(500mg)、硼酸栓剂或两性霉素B阴道泡腾片。
念珠菌病的治疗
深部念珠菌病 两性霉素B是治疗深部念珠菌病的优选药，对播散性深部念珠菌感染最有效，但不良反应也最大。两性霉素B对肝、肾有毒性，需严密监测肾功能和血钾水平。当播散性深部念珠菌感染引起多脏器病变时，可采用两性霉素B(疗程总量2.0～3.0g)联合氟胞嘧啶100mg/(kg·d)进行治疗。对于念珠菌膀胱炎，大多数病例于拔除膀胱导管后即可痊愈，若不愈可口服氟胞嘧啶75～100mg/(kg·d)，连用7～14天;或者口服氟康唑100～200mg/d，连用7～14天。对念珠菌血症患者，氟康唑和两性霉素B均有效。剂量氟康唑治疗，日量400～800mg，连用14天(首次由静脉给药，随后改为口服)。两性霉素B 0.5～1.0mg/(kg·d)，连用7～14天。
对于有两性霉素B耐药或出现肾毒性等不良反应的患者可改用两性霉素B脂质体，开始剂量为1 mg/kg/d一，逐渐增加至3～5 mg/kg/d。对氟康唑耐药患者可用伏立康唑代替，伏立康唑为三代三唑类广谱抗真菌药，活性为氟康唑10～500倍。口服用药，成人200 mg/次，1次/12 h，儿童2～12岁50～150 mg/次。静脉给药首日6mg/kg，维持用量3～4 mg/kg，1次/12 h，2次/d。对多种耐氟康唑、两性霉素B的真菌感染有显著治疗作用。
二、非药物治疗
口咽念珠菌病中，对增生性白斑可采用冷冻、放射和手术治疗。大多数念珠菌心内膜炎患者需作心瓣膜置换手术，以作为药物治疗的辅助措施。处理眼念珠菌病时除应用抗真菌药物治疗还应结合眼科治疗，采用玻璃体切除术去除脓肿玻璃体，预防失明的发生。
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