全身性真菌感染，常可经血流侵及尿路，这种情况颇为常见。但局限于尿路的真菌感染，则甚罕见，常为上行性感染的结果，其发病率约占尿路感染的0%～4.8%。1980年国内首先报道1例，近年来陆续有报道，随着抗生素、免疫遏制剂的广泛应用，诊断方法的进步，以及新技术(如肾移植等)的不断开发，其发病率有逐渐上升趋势。Wise等观察到，念珠菌尿发病率在10年时间从1%升至8%，Hamory等证实，11%的医院内尿路感染由白色念珠菌引起。因此，真菌性尿路感染应引起临床医生，特别是泌尿科医生的重视。
许多真菌都可引起尿路感染，如隐球菌、曲霉菌、毛霉菌、酵母菌、组织胞浆菌和白色念珠菌，其中，以白色念珠菌为最常见。白色念珠菌可侵入泌尿道任何部位，在非妊娠、非糖尿病、非导管插入患者尿中出现白色念珠菌，被认为是全身播散性念珠菌病的早期警告。新型隐球菌可引起肾乳头坏死综合征、肾盂肾炎和类似肾结核的脓尿。
本病感染途径为上行性和血源性，局限于尿路的真菌感染常为上行性，全身性真菌感染侵及尿路则为血源性。
真菌广泛存在于人类皮肤、口腔、胃肠道、肛门和阴道，是典型的条件致病菌。真菌性尿路感染多为继发性，患者常有基础疾病或医源性因素，临床上常见于下列原因：1应用抗生素治疗引起正常菌丛失调，尤其是长期大量使用广谱抗生素时;2激素、免疫遏制剂的使用以及肿瘤病人行放射治疗，使机体的防御功能减弱;3留置导尿管、尿路畸形等尿路局部抵抗力下降;4慢性严重疾病致使体质极度虚弱;5糖尿病病人，抗念珠菌的能力降低，当血糖>8.34mmol/L(150mg/dl)时，白色念珠菌生长率提高;6尿pH：念珠菌生长的适宜pH值是5.1～6.4，正常尿液呈酸性，有利于念珠菌的生长。
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