其中纯型几乎均为良性，仅少数发生恶变。肿瘤可直接引起局部浸润和腹膜种植，一般很少发生淋巴结转移和血行播散。成熟畸胎瘤恶变的发生率为1 %～3%。因肿瘤内有各种不同的组织成分，故可发生各种不同的恶性变化，如鳞癌、腺癌、癌样瘤、黑色素瘤及肉瘤等。其中以鳞癌变最为常见。北京协和医院 647例中11例发生恶变，占1.7%，其中有10例为鳞癌，多自瘤体内的呼吸道上皮、食管上皮或皮肤恶变而来。恶变多见于绝经后妇女，年龄一般在 40～60岁。有报道最小者9岁，为基底细胞及腺癌变，最大88岁，为鳞癌变。该院11例恶变者中，最小32岁，最大77岁，平均51岁。恶变早期多无特殊临床症状，如恶变已扩散浸润周围脏器或者淋巴结转移，则临床症状加重，如腹痛、腿痛、下肢及外阴水肿等。发生恶变的患者主要在绝经后且伴有腹痛症状，也可以有腹部肿块，阴道出血较少见。也有作者指出较大的畸胎瘤(>6cm)恶变的危险较大。发生恶变患者的预后差，且与疾病分期和病理有关。据报道Ⅰ 期鳞癌患者的5年存活率为63%。有卵巢外转移和罕见组织病理(腺癌、肉瘤)的患者预后更差。发生鳞癌变的患者预后不佳，死亡率可达75%～86%。影响预后的因素有：①囊壁是否受侵犯;②与邻近器官癌性粘连程度或分离粘连时囊壁有无破裂;③肿瘤有无淋巴或静脉侵犯;④腹水中有无瘤细胞。
肿瘤如有恶变，瘤体切开后，除油脂、毛发等常见内容以外还有实质性部分，肿瘤组织多呈灰白或浅黄色，质脆，常伴出血及坏死。恶性变化常发生在囊壁内“乳头”或“头节”附近。镜下最多见的是来自表皮的鳞癌，其次为腺癌和类癌，少见的有支气管癌、平滑肌肉瘤、骨肉瘤、基底细胞癌及黑色素瘤等。
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