感染LGV后，血清中出现补体结合抗体，人是此病的单独自然宿主，好侵犯皮肤和淋巴结，LGV的血清型侵袭力较强，引起全身病变多，而不像其他沙眼衣原体血清型主要局限于粘膜，LGV病原体可侵犯巨噬细胞，细胞介导的免疫和体液免疫可以限制但不能完全消除局部和全身感染的扩散， 即使到了晚期仍可以从感染组织中分离出病原体。
本病病原体抵抗力较低，一般消毒剂可将其杀死，在体外存活2-3日，于50℃，30分钟或90℃-100℃，1分钟即可被灭活，70%乙醇，2%来苏，2%氯胺，紫外线及干燥室温中均不能存活。
初疮：为非特异性炎症改变。
淋巴结：有特殊的病理改变——伴有星状脓疡形成的肉芽肿，中央为坏死组织，有多形核白细胞及巨噬细胞浸润，周围绕以上皮样细胞，可见浆细胞，脓肿三角形或四角形，于诊断有参考意义，后期为广泛纤维化及大面积凝固性坏死。
不同时期的临床表现：
一、潜伏期：有不洁性交史，潜伏期7-10天。
二、早期症状：初疮多发生在男性阴茎体，龟头，冠状沟及包皮，女性阴道前庭，小阴唇，阴道口，尿道口周围的5-6mm的极小疱，溃疡，常为单个，有时数个，无明显症状，数日不愈，愈后不留瘢痕，亦可发生于肛周，口腔等处。
三、中期症状，初疮出现1-4周后，男性腹股沟淋巴结肿(第四性病性横痃)，疼痛，压痛，粘连，融合，可见“槽沟征”(腹股沟韧带将肿大的淋巴结上下分开，皮肤呈出槽沟状)，数周后淋巴结软化，破溃，排出黄色浆液或血性脓液，形成多发性瘘管，似“喷水壶状”，数月不愈，愈后留下疤痕，女性初疮多发生于阴道下部，向髂及直肠淋巴结回流，引起该部淋巴结炎，直肠炎，临床可有便血，粘液血便，腹痛，腹泻，里急后重及腰背疼痛，形成肛周肿胀，瘘管，直肠狭窄及大小阴唇象皮肿等。
四、晚期症状：数年或数十年后，长期反复性的腹股沟淋巴管(结)炎可致阴部象皮肿，直肠狭窄等。
五、全身症状：淋巴结肿大化脓期间可有寒战，高热，关节痛，乏力及肝脾肿大等全身症状，亦有皮肤多形红斑，结节性红斑，眼结膜炎，无菌性关节炎，假性脑膜炎。
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