军团菌科仅有一个属，即军团菌属。我国已定型者有Lp1，Lp3，Lp5，Lp6，Lp9等。军团杆菌和过去已知的病原菌无关，故构成单独一个科。
(一)发病原因
根据细胞壁组成，生化反应和DNA杂交研究，军团杆菌和过去已知的病原菌无关，故构成单独一个科，军团菌科仅有一个属，即军团菌属，该属至目前已发现42种，64个血清型，其中约19种自患者分离;
其余则自环境分离，我国已定型者有Lp1，Lp3，Lp5，Lp6，Lp9等，引起疾病者主要是嗜肺军团菌和麦氏军团菌;嗜肺军团菌有15个血清型，约90%属血清Ⅰ型，军团杆菌为革兰阴性杆菌，(0.3～0.9)μm×(2～4)μm，偶见丝状体，有鞭毛，多数为一根，位于顶端，需氧，有动力，病菌在普通培养基中不生长，最适宜的培养基为药用炭-酵母浸出液琼脂(BCYE)，菌落于2～4天后生长，直径为1～2mm，平或微凸，边缘整齐，在F-G琼脂培养基中，3～5天培养可见针尖大小菌落，在紫外线照射下可发出黄色荧光，多数菌种过氧化氢酶弱阳性，硝酸盐酶和尿素酶阴性，仅利用淀粉而不利用其他糖类，生化鉴定一般对鉴定本菌用处不大，常以生长和形态为基础，最后作血清学鉴定，本菌的胞壁含有14～17个碳的支链脂肪酸，和其他细菌不同，可用气相色谱仪检测。
军团菌可产生多种酶和毒素，包括蛋白酶，膦酸酯酶，脱氧核糖核酸酶，β内酰胺酶，以及细胞毒素，可能与毒力有关，本菌有内外二种毒素，其结构和其他革兰阴性杆菌略有不同，不含羟基脂肪酸，而含2-酮-3-脱氧辛酸和特殊支链脂肪酸，细菌在自然环境中生活在淡水中，生物膜上，在蒸馏水中可存活2～4个月，河水中3个月，在自来水中存活1年左右。
(二)发病机制
嗜肺军团菌(Lp)对人体的损害可分为间接损害作用和直接损害作用，间接损害作用是从对肺泡巨噬细胞(Mφ)的作用开始的，研究发现，Lp被Mφ中吞噬后，能抑制吞噬体与溶酶体融合，并能调节单核吞噬细胞内的pH值，以适宜其生存和繁衍;
Lp通过干扰细胞的除极变化而俘获Mφ，成功地完成免疫逃逸，并利用Mφ的营养因素继续生存繁衍，进而裂解Mφ，导致肺泡上皮和内皮的急性损害，并伴水肿和纤维渗出，军团菌亦可通过诱导细胞凋亡的方式产生损害作用，Lp的直接损害作用则主要是其产生的溶血素，细胞毒素和酶类等的作用，吸入的病菌由巨噬细胞所吞噬，并在其吞噬泡内繁殖，产生细胞毒素，杀死巨噬细胞，并侵入其他巨噬细胞，抗体的存在似不能阻止病菌的繁殖，而细胞介导免疫则起重要的抗感染作用，淋巴细胞受抗原刺激而产生的细胞因子可抑制细菌在巨噬细胞内繁殖，此后抗体，补体和多核粒细胞可将病菌消灭，多数患者病变局限于肺部，实变病灶多呈大叶性分布，小部分为局灶性或斑块状分布，死亡病例一般双肺均被累及，上叶和下叶受累的机会无显著差异，实变区肺组织有充血，水肿和局灶性出血，常伴有少量纤维素性胸膜炎，显微镜检查主要为纤维素性化脓性肺炎，肺泡内有大量中性粒细胞浸润，同时有大量吞噬细胞。
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