近半个世纪以来，国内外学者对肝癌的病因进行了广泛而深入的研究。目前我国肝癌的病因有以下几种：
【病因和发病机制】
主要病因为肝脏受到感染后，未及时处理而形成脓肿，都是继发的。临床上常见的有细菌性肝脓肿和阿米巴性肝脓肿。
细菌性肝脓肿指化脓性细菌引起的肝内化脓性感染。肝脏由于接受肝动脉和门静脉的双重血液供应，并通过胆道与肠道相通，故发生感染的机会很多。常见致病菌是大肠杆菌和金黄色葡萄球菌，其次为链球菌、类杆菌属。病原菌侵入肝脏的途径：①胆道系统 ②门静脉系统 ③肝动脉 ④淋巴系统 ⑤肝外伤后继发感染 还有原因不明的肝脓肿，如隐源性肝脓肿，可能与肝内已存在的隐匿性病变有关。
阿米巴性肝脓肿是肠阿米巴病最常见的并发症，多见于温、热带地区。阿米巴滋养体经破损的肠壁小静脉或淋巴管进入肝脏，阻塞门静脉分支，造成肝组织缺血坏死，同时溶解肝组织。如得不到及时治疗，变性坏死的肝组织进一步溶解液化而形成肝脓肿。多位于肝右叶。慢性阿米巴性肝脓肿常合并细菌继发感染。
到目前为止，肝癌的病因还不很清楚。实际上，肝癌的发生是一个多因素、多步骤的复杂过程，众多危险因素在肝癌发生过程中先后或不同程度地发挥作用。我国目前肝癌的已知危险因素主要为乙型或丙型肝炎病毒感染、霉变食品中的黄曲霉毒素污染、饮水中的藻类毒素污染，根据我国国情提出的“改水防霉防肝炎”七字方针，已成为我国肝癌预防的一项重要措施，并已在肝癌高发区显示出明显作用。
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