脑发育不良常见的病因主要有胚胎期脑发育异常或其母亲妊娠期染疾、难产、产伤、出生时窒息、新生儿颅内出血、高热惊厥、一氧化碳中毒、脑炎、脑膜炎、头颅外伤以及遗传因素等。其具体发病原因如下所述。
1、低体重儿：
包括早产未成熟儿和足月小样儿。这些婴儿均不同程度宫内发育迟缓，同时也影响中枢神经系统发育，且常并发室管膜下出血和脑室内出血，后者易引起痉挛性两侧瘫。
2、先天性异常：
包括各种原因引起的脑发育异常，如神经管闭合不全致先天性脑积水，脑泡演化发育障碍所致的全前脑和神经细胞移行障碍所致的平脑回畸形、巨脑回畸形以及小多脑回等。联合障碍所致的透明隔缺如或发育不良也可引起脑发育不良。
3、脑缺氧缺血：
凡能造成母体与胎儿间血液循环和气体交换障碍，或导致新生儿动脉低血压、静脉淤血者，均有可能引起脑缺血缺氧，造成大脑损伤而遗留脑瘫。这此因素包括母亲因素，如患妊娠高血压综合征、心力衰竭、大出血、贫血、休克或**、药物过量等;胎盘异常，如胎盘早剥、前置胎盘、胎盘梗死或胎盘功能不良等;胶带血流阻断，如胶带脱垂、压迫、打结或绕颈等;循环衰竭;红细胞增多症等。
4、核黄疸：
也是脑发育不良的重要病因。但现在由于围产医学进步，核黄疸引起脑发育不平的比例下降。
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