治疗军团病首选大环内酯类或氟喹诺酮类，四环素类、利福平等也有效。青霉素类、氨基糖甙类、头孢菌素类对本病无明显疗效。
一、军团病的治疗药物
体外药物敏感度试验表明军团菌对多种抗菌剂敏感，包括红霉素、利福平、氨基糖苷类抗生素、β内酰胺类中的青霉素类、氯霉素、磺胺甲?唑/甲氧苄啶(复方磺胺甲?唑)、多西环素和氟喹诺酮类等。但动物体内实验表明β内酰胺类抗生素、氯霉素、四环素类及氨基糖苷类抗生素无效。
临床观察表明，红霉素为首选药物。在一次暴发流行中，以红霉素治疗者病死率为5%，不用红霉素而用其他抗菌剂者病死率为24%。红霉素的治疗效果较好，可能与其脂溶性及易于透入巨噬细胞有关。对病情重而不能口服者，推荐应用红霉素500～1000mg,1次/6h，静脉滴注;儿童剂量为15mg/kg体重，1次/6h，静脉滴注。疗程至少2周。有脓肿形成时应将疗程延长。病情较轻者可用红霉素0.5，4次/d，口服，疗程2周。疗程不足者可导致复发。病情严重者可加用利福平治疗，300mg～600mg，2次/d，口服。
近年来大环内酯类抗生素中的罗红霉素(300mg/次，2次/d)、阿奇霉素(500mg/次，1次/d)、克拉霉素(500mg/次，1次/12h)等组织浓度较红霉素高，副作用则较轻，故可代替红霉素。可能的其他抗菌剂选择为多西环素(100mg/次，2次/d，口服)、磺胺甲?唑/甲氧苄啶(复方磺胺甲?唑)[以甲氧苄啶15mg/(kg·d)计算，分3次口服]以及环丙沙星(500mg/次，3次/d，口服)和左氧氟沙星(200mg/次，1次/12h，口服)。
由于氟喹诺酮类药物在实验动物研究中较红霉素更为有效，故应继续积累临床用以治疗军团病的经验。青霉素、头孢菌素、氨基糖苷类抗生素治疗本病无效，故不宜应用。一般在应用有效抗菌剂后1～4天，症状开始好转，寒战、神志改变、肌痛等首先消失，体温亦开始下降，恢复至正常约需时1周。肺部浸润的吸收则更为缓慢。支持疗法对重症患者极为重要，尤其是有呼吸衰竭、休克或急性肾衰竭时。呼吸器辅助呼吸、体液的补充、血管活性药物以及透析等均应按病情需要而及时应用。
二、军团病的预后
未经适当治疗的病例，本病病死率一般为15%～20%，多死于呼吸衰竭。并发急性肾衰竭时，病死率上升为53%。医院内感染的病死率可达60%。经特殊治疗者，病死率为5%左右。有效的早期治疗预后良好。痊愈者除少数神经系统症状严重的可遗留轻微失语和遗忘外，可完全恢复。
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